프로티나·삼성에피스 "AI로 27개월 내 신약 후보 10개 만들겠다"

손영하 2025. 11. 5. 17:10
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프로티나-에피스-서울대 연구팀 컨소시엄
AI 활용 바이오의약품 개발 국책과제 선정
삼성에피스, 인적 분할 후 신약 사업 확장
인천 송도에 있는 삼성바이오에피스 사옥. 삼성바이오에피스 제공

단백질 간 상호작용 빅데이터 기반 신약개발 기업 '프로티나'가 삼성바이오에피스, 서울대와 손잡고 항체 신약 개발에 나선다. 27개월 안에 인공지능(AI)으로 항체 신약 후보물질 10개를 설계하는 것이 목표다.

5일 제약·바이오 업계에 따르면 프로티나는 보건복지부가 주관하는 470억 원 규모의 'AI 모델을 활용한 항체 바이오의약품 개발 및 실증' 국책과제의 주관 연구개발기관으로 선정됐다. 삼성바이오에피스와 백민경 서울대 생명과학부 교수 연구팀이 공동 연구개발 기관으로 참여한다.

컨소시엄은 2027년 말까지 항체 신약 후보물질 10개를 개발할 계획이다. 이 중 후보물질 3개는 비임상시험 단계까지 진행하고, 1개는 임상시험 1상 계획을 신청하는 것을 목표로 세웠다. 27개월 안에 사람을 대상으로 임상시험을 시작할 수 있는 단계까지 가겠다는 뜻이다.

컨소시엄은 시간 단축을 위해 '단절 없는' 개발 플랫폼을 구축했다. 프로티나와 서울대가 공동 개발한 항체 설계 AI(AbGPT-3D)로 △항체 구조 설계 △설계된 구조에 최적화한 아미노산 서열1 생성 △개발 가능성 종합 평가를 한 뒤, 프로티나의 대량 항체 개량 및 성능 측정 플랫폼으로 매주 항체 아미노산 서열 5,000개 이상을 분석하는 방식이다. 프로티나는 "기존 방식으로 수개월이 소요되던 검증 과정을 2주로 단축했다"고 설명했다.

삼성바이오에피스는 발굴된 후보물질을 임상시험이 가능한 바이오의약품으로 완성하는 과정을 책임진다. 높은 생산성과 안정성을 갖춘 세포주를 개발하고, 배양·정제 공정을 최적화하며, 임상 시료 생산을 위한 대규모 생산 공정까지 확립할 계획이다. 특히 이번 과제 수주는 삼성바이오로직스와의 인적분할을 마친 삼성바이오에피스의 신약 개발 사업 확장에 힘을 보탤 것으로 보인다.

양사의 인연은 10여 년 전으로 거슬러 올라간다. 윤태영 프로티나 대표는 삼성전자가 미래 과학기술 육성을 위해 운영하는 삼성미래기술육성재단에서 2014년부터 5년간 지원을 받아 고속 항체 스크리닝 플랫폼 기술의 기초를 다졌다. 윤 대표는 "프로티나의 플랫폼, 서울대의 AI 기술, 삼성바이오에피스의 글로벌 개발 역량을 결합해 AI 신약 개발의 새로운 역사를 쓰겠다"고 말했다.

1 아미노산 서열
단백질을 구성하는 단위 물질인 아미노산들이 서로 결합돼 선형 배열을 이루고 있는 상태. 단백질의 고유한 구조와 기능을 결정하는 중요한 정보가 된다.

손영하 기자 frozen@hankookilbo.com

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